2Фрэд. эффект накладывается не на дорожку, а на инструмент.
Нажимаешь на инструмент. Там в настройках в правом верхнем углу есть переключатель этого канала. Когда выберешь (напр.3) делаешь даблклик, появляется микшер, с выделенным 3 каналом...

Теперь на этот инчтрумент ты можешь наложить 8 эффектов (версия 3.хх) или скока хочешь (нач. с 4 версии)

+можно использовать Send + эффекты, расположенные на канале master
На канал может идти не один инструмент.

fruity scratcher вещь убогая, я не представляю как ты там лабаешь.)))) Выдели любой пустой паттерн, зайди в скрэтчер, нажми правой кнопкой на вертушку->edit events.. и рисуй там график. И не забудь в скрэтчере поставить галочку hold (по-моему)