Рекомендую делать это через WaveLab 3.0 и выше. Незаменимая штука. Я эту прогу юзаю и для разных обработок, и аудио-компакты писать, и, что тебе важно, как кодер. Понимает до хера всяких форматов, кодирует с обилием всяких опций. Отдельные кодеры? С тех пор, как я установил ВэйвЛяп, я забыл, что это такое.