А мне кажется, что если звуковуха дешевая, то дело в АЦП - когда КIRIK просто проигрывает звук через этот вход (не включая запись), звук проходит через аналоговый микшер и выходит в аналоговом виде на разъем выхода, а когда он записывает звук в вав, Аналогова-Цифровой Преобразователь трещит и шуршит из за собственного несовершенства и наводок внутри компьютера, действующих на чувствительный к ним АЦП. Если дело в этом - то ни чего не остается, кроме как поменять звуковую карту.
Еще старые карты не правильно выставляли смещение от цифрового центра (DC Offset). Выход - записывать на небольшой громкости сигнала, потом делать Remove DC Offset и Normalize. KIRIK, ты лучше напиши, что у тебя за звуковая карта - так будет проще выяснить причину щелчков и шума.