Naskol'ko ya ponimayu, eto binarno nesovmestimye sistemy... tak chto raznica v yadre kak vse govoryat. FreeBSD eto UNIX po opredeleniyu, yadro soderzhit v sebe kod razrabotannyi v Berkeley. Linux eto "UNIX workalike" oficial'no, a ne UNIX. Yadro razrabotano Linus'om Torvalds'om.

UNIXami schitayutsya sistemy soderzhashie v sebe kod BSD ili System V (razrabotannyi v Bell Labs, AT&T)